Molly Jaya Indonesia merupakan keturunan keempat dari seorang pembudidaya ikan air tawar pertama di Desa Canggu, Kecamatan Badas, Kabupaten Kediri.

Berawal dari perintis pertama yakni Mbah Taslim yang merupakan pembudidaya pembenihan ikan gurami dan tawes (bader). Kemudian turun ke generasi kedua yakni Mbah H. Mahfud (Menantu Mbah Taslim), yang juga melakukan pembenihan ikan gurami, tawes, mujaer, nila dan ikan mas.

Generasi ketiga yakni Pak Iskandar, beliau mengembangkan budidaya pembenihan ikan gurami, lele, nila dan lobster air tawar. Hingga generasi keempat yakni M. Azam Bakhor Zaidi, yang merintis budidaya ikan hias air tawar. Ikan moli adalah jenis ikan yang pertama kali di budidaya. Oleh karena itu perusahaan ini diberi nama Molly Jaya Indonesia pada tahun 2018.

Pada tahun 2023 CV. Molly Jaya Indonesia telah terdaftar di Direktorat Jenderal Kekayaan Intelektual (DJKI) Kementerian Hukum dan HAM dengan nomor register IDM001131849.